SWlib

目次

• 紹介
• 入手方法
• 使用法
• 連絡方法

紹介

SWlib は Smith-Waterman アルゴリズムを用いて、多数の DNA やタンパク質の配列をアラインメントするための、 基本的な関数を集めたライブラリです。 まだ初期段階なので、使えなくはないというレベルです。

ライブラリ自体は GNU LESSER GENERAL PUBLIC LICENSE (LGPL) に従い、 付属のプログラムは GNU GENERAL PUBLIC LICENSE (GPL) に従います。 ですから、ライブラリを使うだけなら、ソースを公開する必要はありません。 ライブラリ自体を変更した場合、その変更を公開する義務が生じます。 配布を全く行わない場合は関係ありません。

入手方法

現時点での最新は 0.4 です。 http://bioruby.org/archive/contrib/swlib/ からダウンロードできます。

使用法

まだロクなドキュメントがありません。 とりあえず、sw.h を眺めてください。 また、ディストリビューションに入っている、 test というディレクトリの下にサンプルがあります。

連絡方法

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Copyright (C) 2001 OKUJI K. Yoshinori

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Last modified: Fri Feb 23 21:04:43 JST 2001